ISPConfig 3 хранит конфиги в 2 разных файлах - интерфейсном и серверном:

Интерфейс:

/usr/local/ispconfig/interface/lib/config.inc.php

Сервер:

/usr/local/ispconfig/server/lib/config.inc.php

Пароль root от Mysql хранится тут:

/usr/local/ispconfig/server/lib/mysql_clientdb.conf

Если вы забыли пароль к админке ISPConfig , его можно сбросить, выполнив запрос, например, в phpMyAdmin:

UPDATE sys_user SET passwort = md5( 'admin' ) WHERE username = 'admin';

Он присваивает пользователю с логином admin пароль "admin"

Если у вас нет доступа к phpMyAdmin, можно выполнить этот запрос в командной строке mysql.

Залогиниваемся в mysql:

mysql -u root -p

вводим пароль рутового юзера. Для переключения на базу ISPConfig запускаем команду:

use dbispconfig;

Теперь сам запрос:

UPDATE sys_user SET passwort = md5( 'admin' ) WHERE username = 'admin';

и выходим:

quit;